Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms