Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms