Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PSMD6Q15008 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PSMD6Q15008 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PSMD6Q15008 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PSMD6Q15008 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PSMD6Q15008 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PSMD6Q15008 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMD6Q15008 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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