Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms