Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX3Q13761 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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