Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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ITGA7Q13683 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ITGA7Q13683 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ITGA7Q13683 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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ITGA7Q13683 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms