Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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