Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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