Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACACAQ13085 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACACAQ13085 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms