Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN13Q12923 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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