Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCBP1Q09161 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms