Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PUDPQ08623 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms