Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms