Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms