Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms