Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms