Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELAQ04206 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RELAQ04206 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RELAQ04206 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RELAQ04206 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms