Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XPCQ01831 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPCQ01831 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPCQ01831 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
XPCQ01831 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
XPCQ01831 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms