Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA5Q01523 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms