Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MYBPC1Q00872 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms