Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms