Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms