Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms