Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA4P52798 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms