Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms