Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD4P46934 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms