Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG3P32926 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms