Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBP2P32456 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBP2P32456 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBP2P32456 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms