Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms