Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms