Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA4P25789 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms