Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5F1P24539 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms