Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms