Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCP20941 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCP20941 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms