Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2CP19387 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms