Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN1P18031 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms