Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NME1P15531 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NME1P15531 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NME1P15531 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms