Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALM3P0DP25 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM3P0DP25 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms