Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms