Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP10P09238 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP10P09238 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP10P09238 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP10P09238 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP10P09238 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP10P09238 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP10P09238 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP10P09238 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MMP10P09238 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MMP10P09238 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP10P09238 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP10P09238 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP10P09238 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms