Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB1P08034 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB1P08034 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms