Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOX1O75936 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOX1O75936 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms