Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms