Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PMD0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PMD0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PMD0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PMD0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PMD0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PMD0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PMD0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PMD0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PMD0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms