Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
B4E171 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
B4E171 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4E171 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4E171 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4E171 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
B4E171 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms