Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms