Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC169A6NNP5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms