Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms