Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA8A3KMH1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms