Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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